禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV)熒光PCR試劑盒說明書
【產品名稱】
商品名稱:禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV)核酸檢測試劑盒(實時熒光-PCR法)
Name :Avian Influenza/Newcastle Disease Virus (AIV/NDV) Nucleic Acid Detection Kit (Real-time Fluorescence-PCR)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預期用途】
禽流感是由A型流感病毒所引起的禽類疾病。AIV/除了感染禽類外,部分亞型也能夠引起人感染或發(fā)病。野生水禽是禽流感病毒的自然宿主,一般對其不致病,當它們傳染給其它物種時有時會造成大的發(fā)病率和死亡率。2013 年我國*報道了人感染 H7N9 型 AIV,至 2015 年有 571 例感染,212 人死亡。H7N9 AIV 對禽類表現低致病性,它引起家禽很輕微的或不引起臨床癥狀,但對人卻表現很高的致病性[1]。
本試劑盒適用于檢測標本中的禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV),適用于禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV)感染的輔助診斷及流行病學調查。
【檢驗原理】
本試劑盒分別對禽流感AIV和新城疫病毒NDV設計特異性的引物和探針,用一步法熒光RT-PCR技術對AIV/NDV RNA進行體外擴增檢測。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
酶液 50μL×1 管
AIV-H7N9 反應液 1.0mL×1 管
AIV-H7N9 陽性質控品 50μL ×1 管
陰性質控品 250μL ×1 管
注:
1)不同批號試劑不能混用。
2)試劑盒內各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標示的檢測次數。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融少于 7 次,有效期 9 個月。
【適用儀器】
ABI 系列 、安捷倫 MX3000P/3005P 、MJ Opticon2 、Eppendorf 2/4 Color Systems、Bio-RadCFX96 等熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本采集】
病死或撲殺禽,取喉氣管、腦、胸肌、心肌和肺等組織;待檢活禽,用棉拭子取呼吸道分泌物或排泄物,置于 1mL 50%甘油生理鹽水中。
【保存和運輸】
上述標本短期內可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過 6 個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
每份組織分別從 3 個不同的位置稱取樣品約 1g,手術剪剪碎混勻后取 0.5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉至 1.5mL 滅菌離心管中, 8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;棉拭子直接取 100 μL 提取。
1.2RNA 提取
推薦采用上海晅科生物科技有限公司生產的 RNA 提取試劑盒(離心柱提取法),請按照試劑盒說明書進行操作。
2.試劑配制(試劑準備區(qū))
根據待檢測樣本總數,設所需要的 PCR 反應管管數為 N(N=樣本數+1 管陰性對照+1 管陽性對照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應體系配制如下表:
試劑 AIV-H7N9 反應液 酶液
用量 20μL 1μL
將混合好的測試反應液分裝到 PCR 反應管中,21uL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 RNA、陽性質控品、陰性質控品各取 4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內;
4.2
設置好通道、樣品信息,反應體系設置為 25μL;熒光通道選擇: 檢測通道
(Reporter Dye)FAM、CY5, 淬滅通道(Quencher Dye)選擇 NONE,ABI 系列儀器請勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數設置:
步驟 循環(huán)數 溫度 時間 收集熒光信號
1 1cycle 42℃ 20min 否
2 1 cycle 95℃ 10min 否
3 40 cycle 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結果分析判定
5.1結果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現整體傾斜時,根據分析后圖像調節(jié) Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范圍內調節(jié))、stop 值(一般可在 5~20 范圍內調節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.2結果判斷
FAM 通道為禽流感病毒 H7N9 亞型 H7 基因檢測結果,CY5 通道為禽流感病毒H7N9 亞型 N9 基因檢測結果
陽性:檢測通道 Ct 值≤35.0,且曲線有明顯的指數增長曲線。
可疑:檢測通道 Ct 值>35.0,且出現明顯擴增曲線的樣本建議重復試驗,重復試驗結果出現 Ct 值≤35.0 和明顯擴增曲線者為陽性,否則為陰性。
陰性:樣本檢測結果無 Ct 值且無明顯的擴增曲線。
6.檢測方法的局限性
樣本檢測結果與樣本收集、處理、運送以及保存質量有關;
樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現假陽性結果;
陽性對照、擴增產物泄漏,會導致假陽性結果;
病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現假陰性或定 量檢測不準確的結果;
本檢測結果僅供參考,如須確診請結合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7.質控標準
陰性質控品:無明顯擴增曲線且無 Ct 值顯示;
陽性質控品:擴增曲線有明顯指數生長期,且 Ct 值≤32; 以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
【注意事項】
所有操作嚴格按照說明書進行;
試劑盒內各種組分使用前應自然融化,*混勻并短暫離心;
反應液應避光保存;
反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)工作服;
樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學實驗室生物安全通 則》進行處理。
【參考文獻】
[1]Morens D M, Taubenberger J K, Fauci A S. H7N9 avian influenza A virus and the perpetual challenge of potential human pandemicity [J]. MBio,2013, 4(4): e00445-13.
[2]羅思思, 謝芝勛, 劉加波, 等. H7N9 亞型 AIV 雙重實時熒光定量 RT-PCR 檢測方法的建立[J]. 動物醫(yī)學進展, 2013, 34(12):1-5.
[3]徐曉龍, 包紅梅, 馬 勇, 等. H7 和 N9 亞型及 A 型流感病毒多重熒光 RT-PCR 檢測方法的建立[J].中國預防獸醫(yī)學報, 2014, 12, 36: 939-942.
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