豬瘟藍(lán)耳口蹄疫CSFV/PRRSV-U/FMDV-U熒光PCR說明書
【產(chǎn)品名稱】
商品名稱:豬瘟病毒/豬藍(lán)耳病病毒通用型/口蹄疫病毒通用型(CSFV/PRRSV-U/FMDV-U)核酸檢測試劑盒(實(shí)時(shí)熒光-PCR 法)
Name :Classical swine fever virus / swine ear disease virus universal / foot-and-mouth disease virus universal (CSFV/PRRSV-U/FMDV-U) nucleic acid detection kit (real-time fluorescence -PCR)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預(yù)期用途】
口蹄疫病毒(FMDV)屬小 RNA 病毒科屬,是小的動(dòng)物病毒之一,在世界范圍廣泛分布,其中,O、A、C 型 FMDV 的毒力和抗原性均易發(fā)生變易,幾乎遍布亞、非、拉、歐各洲;AsiaⅠ型主要分布在亞洲;SATI、SAT2、SAT3 型主要分布在非洲[1-2]??谔阋卟《狙逍蛷?fù)雜多變,為檢測帶來了較大的難度[3]。
本試劑盒適用于檢測口蹄疫易感動(dòng)物的水泡皮及水泡液、O/P 液等標(biāo)本中口蹄疫病毒通用型 RNA,適用于口蹄疫病毒通用型感染的輔助診斷。
【檢驗(yàn)原理】
本試劑盒對口蹄疫病毒通用型特異核酸序列設(shè)計(jì)引物和探針,用一步法熒光RT-PCR 技術(shù)對口蹄疫病毒通用型 RNA 進(jìn)行體外擴(kuò)增檢測,用于臨床上對可疑感染者的病原學(xué)診斷。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
酶液 50μL×1 管
FMDV-U 反應(yīng)液 1.0mL×1 管
FMDV-U 陽性質(zhì)控品 50μL ×1 管
陰性質(zhì)控品 250μL ×1 管
注:
1)不同批號試劑不能混用。
2)試劑盒內(nèi)各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標(biāo)示的檢測次數(shù)。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運(yùn)輸、反復(fù)凍融次數(shù)不超過 5 次,有效期 12 個(gè)月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測儀。
【標(biāo)本采集】
病死或撲殺動(dòng)物,取水泡皮及水泡液;待檢活動(dòng)物,取 O/P 液 2~3mL。
【保存和運(yùn)輸】
上述標(biāo)本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過 6 個(gè)月,標(biāo)本運(yùn)送應(yīng)采用 2~8℃冰袋運(yùn)輸,嚴(yán)禁反復(fù)凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
水泡皮樣品:稱取水泡皮 0.5g 于研磨器中研磨,加入生理鹽水繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至 1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;OP 液或水泡液樣品,直接取 100μL 置于 1.5mL 滅菌離心管中。
1.2RNA 提取
推薦采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的RNA 提取試劑盒(離心柱提取法),請按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。
2.試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設(shè)所需要的 PCR 反應(yīng)管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對照+1 管陽性對照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑 FMDV-U 反應(yīng)液 酶液
用量 20μL 1μL
將混合好的測試反應(yīng)液分裝到 PCR 反應(yīng)管中,21uL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 RNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 4μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR 擴(kuò)增(核酸擴(kuò)增區(qū))
4.1將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量 PCR 儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.2設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為 25μL;熒光通道選擇: 檢測通道
(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)NONE,ABI 系列儀器請勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時(shí)間 收集熒光信號
1 1 cycle 42℃ 20min 否
2 1 cycle 95℃ 10min 否
3 40 cycles 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設(shè)定
設(shè)置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機(jī)器自動(dòng)分析的結(jié)果分析,當(dāng)曲線出現(xiàn)整體傾斜時(shí),根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的start 值(一般可在 3~15 范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、
stop 值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動(dòng)閾值線至高于陰性對照),重新分析結(jié)果。
6.質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:無明顯擴(kuò)增曲線丏無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)生長期,丏 Ct 值≤32; 以上條件應(yīng)同時(shí)滿足,否則實(shí)驗(yàn)視為無效。
【參考文獻(xiàn)】
[1]Mulle JD,McEachern JA,Bossart KN,et al. Serotype-independent detection of foot-and-mouth disease virus [J]. J Virol Methods [J].2008,151(1):146-153.
[2]吳紹強(qiáng).亞歐型及南非型口蹄疫一步法多重?zé)晒?RT-PCR 檢測方法建立[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2010,43(14):3019-3026.
[3]Mason PW,Grubman MJ,Baxt B. Molecular basis of pathogenesis of FMDV [J].Virus Res,2003,91(1):9-32.
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